Aena ofrece a las compañías aéreas servicios, compromisos e indicadores de calidad.
Para cumplir, como valor esencial, la atención a los clientes y usuarios, Aena trabaja conjuntamente con las compañías y con todas las empresas relacionadas con el transporte aéreo. Todo esto está recogido en una Carta que ha editado la Dirección de Aeropuertos. En esta sección el usuario accede a un directorio donde puede encontrar todas las compañías aéreas españolas con un servicio de facturación web y coordinación de slots.
(Listado obtenido de: http://es.wikipedia.org/)
El aeropuerto tiene vuelos directos tanto nacionales como desde y hacia toda Europa, Canadá, Estados Unidos, norte de África, Israel y Oriente Medio:
- Aer Lingus: Belfast, Cork, Dublín, Londres-Gatwick.
- Aeroflot: Moscú-Sheremetyevo.
- Air Baltic: Riga, Vilna.
- Air Berlin: Alicante, Berlín-Tegel, Colonia/Bonn, Dusseldorf, Fráncfort del Meno, Hamburgo, Hanóver, Muenster, Múnich, Núremberg, Paderborn/Lippstadt, Palma de Mallorca.
- Air Europa: Madrid-Barajas, París-Charles de Gaulle, Tenerife Sur.
- Air Finland: Helsinki.
- Air Transat: Montreal /P. E. Trudeau, Toronto-Pearson.
- Alitalia: Milán-Malpensa, Roma-Fiumicino.
- Ándalus Líneas Aéreas: Nador, Casablanca, Marrakech y Lisboa.
- A.S. Air-X: Bergen, Copenhague, Estocolmo, Moss, Oslo, Stavanger, Varsovia.
- Austrian Airlines: Viena.
- Blue Air Transport Aerian: Bucarest-Baneasa.
- British Midland: operado por British Midland Regional: Birmingham, Cardiff, Manchester, East Midlands.
- British Airways: Londres-Heathrow.
- Brussels Airlines: Bruselas.
- Bulgaria Air: Sofía.
- Channel Express: Belfast, Blackpool, Leeds/Bradford, Manchester, Newcastle.
- Cimber Air: Aalborg, Billund, Copenhague.
- Compañía RGL: Casablanca, Tánger.
- Cóndor: Stuttgart, Fráncfort del Meno, Múnich.
- Delta: Nueva York-JFK.
- EasyJet: Belfast, Berlín-Schönefeld, Bristol, Dortmund, Glasgow, Liverpool, Londres-Gatwick, Londres-Luton, Londres-Stansted, Manchester, Milán-Malpensa, Newcastle, East Midlands.
- EasyJet Switzerland: Basilea-Mulhouse, Ginebra.
- Finnair: Helsinki.
- Flybe: Exeter, Southampton.
- Germanwings: Stuttgart.
- Helicópteros del Sureste: Ceuta.
- Iberia: Madrid-Barajas.
- Iberia regional operado por Air Nostrum: Alicante, Asturias, Casablanca, Gran Canaria, Ibiza, Lanzarote, Melilla, San Sebastián, Santander, Tenerife Norte, Valencia, Valladolid.
- Jetair Fly: Alicante, Bruselas.
- Kuwait Airways: kuwait city.
- Lithuanian Airlines: Riga, Vilna.
- Lufthansa: Fráncfort del Meno, Düsseldorf, Múnich.
- Luxair: Luxemburgo.
- Malev Hungarian Airlines: Budapest.
- Mayoral Executive Jet: Aeropuerto a Aeropuerto.
- Monarch Airlines: Birmingham, Londres-Gatwick, Londres-Luton, Manchester.
- NL Luftfahrt: Viena.
- Norwegian Air Shuttle: Aalborg, Bergen, Billund, Copenhagen, Estocolmo-Arlanda, Oslo-Gardermoen, Oslo-Rygge, Stavanger, Trondheim, Varsovia.
- Oy Air Finland: Helsinki.
- Regional Air Lines: Casablanca, Tánger
- Ryanair: Bremen, Birmingham, Bournemouth, Charleroi-Bruselas Sur, Dublín, Düsseldorf-Weeze, East Midlands, Edimburgo, Fráncfort-Hahn, Glasgow, Liverpool, Londres, Marsella, Bérgamo-Orio al Serio (empieza el 5 de julio), Niederrhein, Santander, Shannon, Valladolid Zaragoza .
- Saudi Arabian Airlines: Riadh, Yeddah.
- Scandinavian Airlines System: Aalborg, Billund, Copenhague, Estocolmo-Arlanda, Gotemburgo, Oslo.
- Scandinavian Airlines System: Estocolmo-Arlanda, Gotemburgo, Oslo.
- Swiftair: Zaragoza (vuelo suprimido)
- Swiss International Air Lines: Ginebra, Zúrich.
- TAP Air Portugal: Lisboa.
- Thomson Airways: Bournemouth, Coventry, Doncaster, Newcastle.
- Transavia.Com: Ámsterdam-Schiphol, Eindhoven, Rotterdam.
- Vueling Airlines: Ámsterdam-Schiphol, Barcelona, Bilbao, Gran Canaria, París-Charles de Gaulle, Roma-Fiumicino, Santiago de Compostela.